肿瘤微卫星不稳定(MSI)检测
产品概述
微卫星是遍布于人类基因组中的短串联重复序列,微卫星不稳定性(MSI)是指DNA甲基化或者基因突变致错配修复基因缺失,从而导致微卫星重复序列插入或缺失,继而长度改变,与肿瘤的发生密切相关。
据文献报道,大约15%的结直肠癌中存在MSI现象,与无MSI特征的结直肠癌相比,其发病机制、预后和对药物的敏感性均不同。在非结直肠癌的实体瘤中也存在着不同比例的MSI-H的现象,MSI状态不同的实体瘤对免疫检查点抑制剂药物响应率方面有显著差异。
睿博兴科采用荧光PCR-毛细管电泳法检测MSI状态是目前国际公认的金标准,NCCN、ASCO等国际知名机构联合推荐。同时提取同一患者正常组织和肿瘤组织DNA,采用多重荧光PCR技术对检测位点进行扩增,再通过毛细管电泳对扩增产物进行检测,最后利用专业软件对两种组织来源的检测结果进行比对分析。
技术流程
可提供的服务
(1)基因组DNA提取、多重PCR扩增、毛细管电泳检测
(2)按照您实验的要求,为您设计实验方案。包括:荧光标记的选择,实验条件摸索,内标的选用等等。
(3)合成荧光引物
(4)根据所设计的实验方案用引物完成PCR扩增
(5)GeneMarker软件对收集到的数据进行初步处理分析,审核数据的质量
技术优势
(1)成熟的技术平台:美国应用生物系统公司ABI 3130XL基因分析仪、GeneMarker分析软件;
(2)多重检测:一个泳道可以同时检测3-5种不同的荧光;
(3)周期短:散样一般是从收到订单时起,检测上机只需48小时即可收到结果, 默认仅提供审核复检;
送样要求
(1)基因组DNA:浓度20-30ng/ul以上,OD260/280在1.7-2.1左右,需冰袋运输,需要本公司提取基因组,需要阐明特殊样品类型。
(2)可处理的样本类型
动物组织 |
500mg以上,需低温运输 |
血液(抗凝血) |
>1ml,需低温运输 |
细胞: |
大于106,收集细胞沉淀,需干冰运输 |
石蜡切片: |
10*10*8um的切片不少于10片,需常温运输 |
检测结果
(1)ABI3730XL电泳的原始文件(fsa格式)和分析文件
(2)每个样品孔样品毛细管电泳峰图(JPG格式)
(3)实验报告
结果示例
检测图谱
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