微生物是指细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等在内的一大类生物群体,虽然它们个体微小,却与大自然关系密切。微生物基因组的重测序是指对细菌或真菌的基因组重测序。其重测序的原理是基于小片段文库的高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法,检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物重测序能够快速解析菌株之间的变异信息,进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。
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