菌种鉴定
细菌鉴定:
16SrDNA:总长1.5kb的序列,其中包含有10个保守区和9个可变区域(高变区)(如图1)。其中保守区为所有细菌共有,细菌间无差别,反映物种的亲缘关系;可变区具有属或种的特异性,序列随菌间亲缘关系不同有一定的差异。本公司可通过对16SrDNA全长或其中的部分可变区域进行测序,利用测序结果比对相似度来确定细菌的种类。
图1. 细菌16s rRNA
真菌鉴定:
ITS(Internal Transcribed Spacer):5.8S rDNA 和 28S rDNA 基因间隔序列,可用于不同真菌种、属的分类鉴定。核糖体DNA中的18S、5.8S和28S的基因组序列在大多数生物中趋于保守,在生物种间变化小;而内转录间隔区ITS1 和ITS2作为非编码区(如图2),承受的选择压力较小,相对变化较大,并且能够提供详尽的系统学分析所需要的可遗传性状。
图2. 真菌ITS
菌种鉴定应用范围:
项目流程:
服务特色:
1.对革兰氏阳性细菌和酵母有简便易行的破壁方法,可快速得到扩增模板;
2.使用公司自主研发的比对软件,快速准确的进行数据比对,缩短项目周期;
3.提供电泳胶图;
4.提供实验流程相关数据。
5.从收样到系统进化树全线打通,技术服务一步到位。
6.提供blast比对结果
结果示例:系统发育树示例:
送样要求及订单:微生物菌种鉴定订单 下载
联系我们:
手机号码:18001027002(微信同号);
地址:北京市大兴区亦庄经济开发区地盛东路1号爱普益大厦2幢401
电话:010-81766077(总部)
项目:support@ruibiotech.com
测序:seq@ruibiotech.com
引物:dna@ruibiotech.com
基因:gene@ruibiotech.com
STR: str@ruibiotech.com
地址:北京市昌平区北七家镇宏福产业园B2008-2010