BSP甲基化测序
简介
DNA甲基化是最早发现的修饰途径之一,真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶(C)。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因的表达。甲基化会使胞嘧啶转化为5’-甲基胞嘧啶,CpG位点在基因组是不常见的,主要密集于接近基因启动子的位置,统称为CpG岛。CpG位点的甲基化可以对基因表现有重要的影响。
目前本公司主要提供BSP甲基化测序检测技术服务。该技术原理如下:
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计在CpG岛两端设计引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列比对,统计甲基化位点及数量,并分析甲基化程度。
1. 技术流程
2. 结果示例
3. 可提供的服务
(1) 基因组DNA提取
(2) 查找CpG岛
(3) 引物的设计与合成
(4) 基因组亚硫酸盐处理
(5) BSP-PCR扩增
(6) TA克隆
(7) 一代测序
4. 送样要求
组织:500mg以上,需低温运输
血液(抗凝血):>1ml,需低温运输
细胞:大于106,收集细胞沉淀,需干冰运输
基因组DNA样品要求OD260/OD280=1.8~2.0,浓度大于100ng/ul,总量大于2ug,琼脂糖电泳条带清晰无降解。
5. 公司提供的结果
一代测序结果
6.联系我们
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